Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
ITGA9Q13797 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms