Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RUNX3Q13761 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms