Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1SQ13698 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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