Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTCH1Q13635 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTCH1Q13635 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTCH1Q13635 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTCH1Q13635 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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