Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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BFSP2Q13515 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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BFSP2Q13515 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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BFSP2Q13515 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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BFSP2Q13515 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
BFSP2Q13515 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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