Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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