Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SEMA3FQ13275 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms