Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms