Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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CHAF1BQ13112 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
CHAF1BQ13112 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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