Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CSTF3Q12996 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CSTF3Q12996 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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