Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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FAM3AP98173 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FAM3AP98173 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FAM3AP98173 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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