Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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SFTPDP35247 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SFTPDP35247 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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