Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ARID4AP29374 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms