Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPRDP23468 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRDP23468 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
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