Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRAP18433 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRAP18433 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRAP18433 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRAP18433 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTPRAP18433 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRAP18433 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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