Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VPREB1P12018 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms