Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms