Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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SH3BP1Q9Y3L3 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SH3BP1Q9Y3L3 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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