Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
USP35Q9P2H5 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
USP35Q9P2H5 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms