Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
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FOXQ1Q9C009 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXQ1Q9C009 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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