Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HIRIP3Q9BW71 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms