Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
RBM42Q9BTD8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
RBM42Q9BTD8 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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