Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CHCHD4Q8N4Q1 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CHCHD4Q8N4Q1 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms