Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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