Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLC27A3Q5K4L6 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms