Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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CCDC142Q17RM4 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
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