Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CNGA3Q16281 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 419.8 ms