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| ATP6AP1 | Q15904 | TRIQK-212 | ENST00000520686 | 1808 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MT-ND2-201 | ENST00000361453 | 1042 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA71.3-201 | ENST00000362582 | 128 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-223P-201 | ENST00000362830 | 107 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-741P-201 | ENST00000383889 | 107 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA18.3-201 | ENST00000384122 | 132 nt | BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AF274854.1-201 | ENST00000413236 | 615 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL592148.1-201 | ENST00000413568 | 445 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | XKRYP1-201 | ENST00000423438 | 492 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC092047.1-201 | ENST00000424997 | 240 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | XKRYP2-201 | ENST00000432915 | 492 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MACC1-AS1-201 | ENST00000439285 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | LINC01997-201 | ENST00000494900 | 429 nt | TSL 2 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ANKRD36B-207 | ENST00000497329 | 649 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC098868.1-201 | ENST00000512628 | 624 nt | TSL 2 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA31.21-201 | ENST00000517180 | 77 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC090888.1-201 | ENST00000561335 | 1141 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009163.5-201 | ENST00000575421 | 637 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC135178.3-204 | ENST00000585181 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP000811.1-201 | ENST00000603803 | 651 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC091965.4-201 | ENST00000607691 | 587 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ANKRD36C-207 | ENST00000612359 | 650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | C8orf59-208 | ENST00000612809 | 475 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC079395.3-201 | ENST00000615161 | 484 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC023510.2-201 | ENST00000622162 | 746 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC073308.1-201 | ENST00000623696 | 305 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND1P37-201 | ENST00000636562 | 264 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NF1-214 | ENST00000490416 | 1329 nt | TSL 3 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SLCO1B3-201 | ENST00000261196 | 2840 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | IL33-201 | ENST00000381434 | 2641 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SERPINI2-209 | ENST00000616363 | 1769 nt | TSL 5 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NDUFAF4-201 | ENST00000316149 | 2399 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR422A-201 | ENST00000362286 | 90 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP374-201 | ENST00000362939 | 125 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA9-201 | ENST00000384215 | 133 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP171-201 | ENST00000391071 | 115 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6ATAC16P-201 | ENST00000408591 | 138 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU2-33P-201 | ENST00000410344 | 192 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL513331.1-201 | ENST00000411908 | 397 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL117337.1-201 | ENST00000412789 | 444 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL21P24-201 | ENST00000413752 | 448 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HIGD1AP15-201 | ENST00000416198 | 280 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | VPS26BP1-201 | ENST00000417155 | 755 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |