Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
USF2Q15853 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
USF2Q15853 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
USF2Q15853 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
USF2Q15853 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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