Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NEDD8Q15843 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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