Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RUNX2Q13950 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms