Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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