Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ALCAMQ13740 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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