Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTCH1Q13635 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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