Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IRF5Q13568 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms