Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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NAE1Q13564 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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NAE1Q13564 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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NAE1Q13564 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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NAE1Q13564 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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NAE1Q13564 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
NAE1Q13564 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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