Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
BFSP2Q13515 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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