Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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