Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
ERCC8Q13216 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms