Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRAF1Q13077 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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TRAF1Q13077 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRAF1Q13077 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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