Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXF2Q12947 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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