Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNTN1Q12860 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNTN1Q12860 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms