Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KIF5AQ12840 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms