Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CPSF1Q10570 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CPSF1Q10570 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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