Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PGGT1BP53609 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms