Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPREP23469 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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