Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VEGFDO43915 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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VEGFDO43915 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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VEGFDO43915 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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VEGFDO43915 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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VEGFDO43915 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VEGFDO43915 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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