Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SOBPA7XYQ1 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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