Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SHOC2Q9UQ13 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms