Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COPS7AQ9UBW8 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms